El Palacio de Gobierno en Baja California Sur, como todas las entidades federativas de la república está unida al país, por el vinculo de la federación.
Que se encuentra regido por sus propias leyes dentro del marco de la Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos, los poderes de la nación:
El Poder Ejecutivo: el cual esta representado por el gobernador del estado.
El Poder Legislativo: el cual reside en el congreso del estado.
El Poder Judicial: el cual es representado por el Tribunal Superior de Justicia del Estado.