Al mismo tipo, Hernán Cortés inició la expedición de las Hibueras (Honduras en 1524. Se le unió Pedro de Alvarado, y concretaron la conquista de Centroamérica, Hernán Cortés tuvo que retirarse de la expedición por las noticias recibidas desde la capital virreinal. Dada la ausencia del conquistador, Gonzalo de Salazar, y Pedro Almindez Chirinos tomaron el mando del gobierno, cometiendo abusos que propiciaron rebeliones de indios y españoles en todo el territorio.
La Corona española solicitó la presencia de Cortés en España Mientras se le aplicaba sura de residencia, Nueva España era gobernada por la primera Audiencia, dirigido por Nuño Beltrán de Guzmán, quien condujo la exploración a Guanajuato, Zacatecas, Jalisco, Michoacán, Nayarit, Sinaloa y Sonora.
Cuando regresa Hernán Cortés de nuevo la encomienda de organizar exploraciones hacia el litoral del Pacífico y del golfo de California, entre estas, destacaron la encabezada por Diego Hurtado de Mendoza en 1332, quien partió de Acapulco, llegó a Jalisco y tocó las islas Marías y Bahía de Banderas,
Ya que las exploraciones de Ortuño Jiménez y Hernando Grijalva quienes partieron en 1532 de Santiago (Manzanillo), pero una tormenta los separo, Grijalva fue llevado hasta las islas Revillagigedo, Ortuño llegó a Bahía de la Paz y continuo por el golfo de California hasta Guaymas.
Los fracasos de los conquistadores en las costas del Pacífico y California en 1535 obligaron a Cortés a construir una flota en Salina Cruz y bordear Nueva España hasta Cabo San Lucas. Fundó Santa Cruz, hoy conocida como La Paz, y recorrió el golfo de California, nombrándolo mar de Cortés.
Estas expediciones también brindaron conocimientos sobre los territorios recién conquistados, desde Oaxaca hasta Sonora y gran parte de la península de Cabeza de California
La única expedición terrestre que abarcó gran territorio y no tuvo carácter de conquista fue la efectuada por Álvar Núñez Cabeza de Vaca, sobreviviente de la expedición que Pánfilo de Narváez inició en las Antillas en 1528 para conquistar
